③ DSH 插件区（重点推荐）

#三种装法

常用命令（在 DSH 终端里打）：

dsh plugin add <插件名>       # 安装（默认装到当前用的 profile）
dsh plugin remove <插件名>    # 卸载
dsh plugin update            # 更新已装的全部插件
dsh plugin --profile web add <插件名>   # 指定装到某个 profile

#装完必做三件事

1. 重启 App（托盘右键 → 退出，再打开）—— 90% 的"装了没反应"都是忘了这步
2. 开一个新会话（旧会话可能没加载到新工具）
3. 验证：在会话里问一句「你现在有哪些工具？」或「列出你所有的工具」，看新插件在不在

#⚠️ 三个坑，先记住

#装之前可以先"体检"（可选但推荐）

#🔧 三者的共同前置条件（很重要）

1. 本机装 Zotero 7 及以上（推荐 Zotero 8/9），并且保持运行
2. 打开 Zotero → 设置 → 高级 → 通用 → 勾选 「允许本机上的其他应用程序与 Zotero 通信」
3. Zotero 默认监听 http://127.0.0.1:23119，不需要 API Key

#📚 ① dsh-zotero —— 让 AI 直接读你的 Zotero 文库

• 仓库：https://github.com/Hongcheng-LI/dsh-zotero
• 一句话：搜索文库、读元数据/摘要/全文、列附件、把 PDF 下载到会话工作区、读写笔记

安装：

dsh plugin add dsh-zotero

（或从 GitHub：dsh plugin add github:Hongcheng-LI/dsh-zotero，装完重启 App）

它给你的 9 个工具：

可以这样用（直接抄）：

在我的 Zotero 里搜一下 "single cell" 相关的论文，挑 2020 年以后的，
把第一篇的全文读一遍，给我写一份结构化摘要，存成笔记。

⚠️ 注意：

• 笔记写入多数版本用不了 —— Zotero 本地 API 一般是只读的（POST/PATCH/DELETE 没开放），插件会明确提示，不会静默失败。要写笔记还是手动在 Zotero 里写。
• 附件下载默认存到会话工作区，想固定目录可以在配置里改。

可选配置（在 profile 的 cordis.patch.yml 里改 tool-zotero 行）：baseUrl、library（user 或 group:群组ID）、downloadDir、maxAttachmentBytes（默认 64MB）、maxFulltextChars（默认 80000）、maxLimit（默认 50）。

#🔗 ② zotero-mcp-dsh —— 专为写论文 / LaTeX

• 仓库：https://github.com/LiJunfeng000000000000/zotero-mcp-dsh
• 一句话：把 Zotero 库变成 MCP 工具，重点是导出 BibTeX + 生成 \cite{} —— 写论文/毕业设计时最有用

安装：

dsh plugin add github:LiJunfeng000000000000/zotero-mcp-dsh

装完重启 DSH，工具列表里会出现 mcp__zotero__*。

它给的 5 个工具（都带 mcp__zotero__ 前缀，不会和别的插件撞名）：

写作工作流（作者给的 4 步）：

① 找文献 → ② 用全文核对内容 → ③ 生成 .bib 写进 references.bib → ④ 正文写 \cite{citekey}

⚠️ 注意：

• 这个插件是只读的，不会改你的 Zotero 库
• 强烈建议同时装 Zotero 的 Better BibTeX 插件，citekey 才稳定
• PDF 全文靠 Zotero 的全文索引；没索引的文献要去 Zotero 里右键「重新索引」

#🌾 ③ zotero-harvest —— 自动"检索 → 判断够不够 → 入库"

• 仓库：https://github.com/Fisfzy/zotero-harvest
• 一句话：把「找文献 → 判断文献够不够 → 存进 Zotero → 能立刻被检索到」这条链路做成 6 个确定性工具。做系统性综述时的"采集机"

它检索的免费数据源（都不需要 Key）：

6 个工具：

可用的对话：

用 lit_review_run 帮我做「肝癌 单细胞 免疫微环境」这个主题的文献采集：
至少 5 篇核心 + 10 篇总共，最多跑 3 轮，采完存进 Zotero 的「综述-肝癌」分类。
跑之前先告诉我你打算用哪些检索词。

⚠️ 注意：这个插件作者的安装方式是开发者式的（dshx install zotero-harvest <插件目录>），比前两个麻烦一点。 如果你只是想用，先跳过它，等前面的用熟了再回来折腾（README 写得很清楚，照着做）。

#🌊 ④ 延伸：zotero-wave-rag —— 让检索"懂关系"

• 仓库：https://github.com/Fisfzy/zotero-wave-rag
• 一句话：面向 Zotero 库的 RAG 检索系统，直读 zotero.sqlite，能用上"标签关系网 + 全文 BM25 + 中英桥"
• 为什么值得知道：普通检索只能找到"字面像"的论文；它还能顺着共享标签/作者往外跳，找到"语义不像但其实相关"的论文
• 工具：zotero_status、zotero_search、zotero_paper_detail、zotero_compare（多篇并排对比）、zotero_embedder（切换嵌入模型）
• 嵌入模型可选：hash（免费离线，开箱即用）/ bge-m3（推荐，需 API Key）/ Qwen 系列

⚠️ 重要提醒：dsh-zotero 和 zotero-wave-rag 都注册了 zotero_search 这个工具名，别同时装，二选一。 （zotero-mcp-dsh 的工具名带 mcp__zotero__ 前缀，可以和它们共存。）

#🧭 三件套怎么分工（一张表看懂）

• 仓库：https://github.com/Aik358/dsh-literature ｜ npm：@a9i5k4/dsh-literature
• 一句话：一个插件顶四个——文献库 + PDF 阅读器 + 划词翻译 + 引用格式生成器，而且不装 Zotero 也能单独用

安装（一行命令）：

dsh plugin add @a9i5k4/dsh-literature

装完重启 App，侧边栏会出现「文献」入口。

它能干什么：

为什么强烈建议她先装这个：

• 门槛最低：不依赖 Zotero（保存方式可选"内置文献库"），装上就能用
• 覆盖了她 80% 的日常动作：看 PDF、翻译、记高亮、生成中文参考文献格式
• 中文学位论文要的 GB/T 7714-2015 格式直接内置，不用自己拼
• 有 QQ 交流群，出问题好问人

zotero_lookup 是什么：它同时提供让 AI 调用的 zotero_lookup 工具，所以你可以直接在对话里说：

帮我找一下 DOI 10.1038/xxxxx 这篇，下载全文，然后总结它的方法部分。

和 Zotero 的关系：它是 Zotero 生态的独立兼容实现，和 Zotero 官方无隶属关系。装上 Zotero 后也能把条目导出到 Zotero（走官方 Connector 协议）。

兼容性要求：DSH ≥ 0.1.1-rc.2、Node ≥ 20；本地 Zotero 可选（8.x）。

#🧠 管理技能和 MCP（管好你的"工具箱"）

#🐍 跑代码 / 处理数据（生信必需）

#👁 让 AI"看得见"（读图、OCR、扫描件）

#📄 Office / 报告 / 笔记

#💰 看花销（学生党必装）

#↩️ 后悔药（防手抖）

#🔬 重量级：DSH Scholar（科研操作系统）

• 仓库：https://github.com/lzszq/dsh-scholar
• 一句话：把「项目对话 + 研究材料 + 代码数据 + 受控实验 + 证据 + TeX 论文」全部放进一个可追溯的项目里。流程是：

建项目 → Grill Me 追问 → 定 Scope → 文献综述 → 出 Idea → 基线 → 定 Contract
→ 受控实验 → 结果分类与综合 → 证据与结论 → TeX 写作与评审 → 人工放行

• 它特别"学术"的地方：gate-only 是默认模式 —— AI 不能伪造"已通过的证据"，也不能绕过研究节点的确认；每次实验必须绑定不可变的代码和数据快照
• 明确说了面向：机器学习、数据科学、生物信息学 等计算型研究

#📖 其他学术向（都在插件市场里，搜名字即可）

#🧠 记忆与上下文（长项目必备）

万一装崩了怎么办（记住这一招）：

• 从托盘的 Harness 菜单 → 以安全模式重启（Safe Mode） → 它会临时屏蔽所有第三方插件，让你能进去把坏插件卸掉
• 完全进不去界面：用命令行启动并加参数 --safe-mode
• 报 bug 用：托盘右键 → 导出诊断信息…

#📅 第 1 天（只装这 3 个）

dsh plugin add @a9i5k4/dsh-literature
dsh plugin add dsh-skill-manager
dsh plugin add @huanlin/dsh-plugin-interpreters

#📅 第 1 周（再补 4 个）

#📅 写论文的时候

#📅 做综述的时候

#📅 以后进阶（现在别碰）